(19)国家知识产权局
(12)发明 专利申请
(10)申请公布号
(43)申请公布日
(21)申请 号 202210965724.4
(22)申请日 2022.08.12
(71)申请人 太原理工大 学
地址 030024 山西省太原市迎泽西大街79
号
(72)发明人 吴永飞 张帆 欧阳佳子 马雪涛
刘雪宇 李明
(74)专利代理 机构 太原晋科知识产权代理事务
所(特殊普通 合伙) 14110
专利代理师 赵江艳
(51)Int.Cl.
G06V 10/764(2022.01)
G06V 10/774(2022.01)
G06V 10/82(2022.01)
G06V 10/80(2022.01)G06V 10/25(2022.01)
G06T 7/00(2017.01)
G06T 7/10(2017.01)
G06N 3/04(2006.01)
(54)发明名称
基于融合卷积神经网络的肾组织染色图像
质量评估方法与系统
(57)摘要
本发明属于人工智能辅助医疗检查技术领
域, 公开了一种基于融合卷积神经网络的肾组织
染色图像质量评估方法及系统, 包括以下步骤:
S1、 采集肾组织的全视野数字切片, 并处理得到
下采样全视野数字切片和肾小球感兴趣区域;
S2、 对下采样全视野数字切片和肾小球感兴趣区
域分别进行质量等级标注, 构建专家标签数据
集; S3、 将标注后的下采样全视野数字切片和肾
小球感兴趣区域分别输入融合卷积神经网络模
型进行训练, 得到DWSI分类模型和G ‑ROI分类模
型; S4、 对待评估的全视野数字切片进行下采样
和分割后分别输入训练完成的分类模 型, 根据输
出计算加权质量 分数; S5、 确定质量等级。 本发明
提高了切片质量评估精度, 可嵌入设备辅助医生
快速判断切片是否符合标准。
权利要求书3页 说明书11页 附图6页
CN 115393636 A
2022.11.25
CN 115393636 A
1.一种基于融合卷积神经网络的肾组织染色图像质量评估方法, 其特征在于, 包括以
下步骤:
S1、 采集肾组织的全视野数字切片WSI, 并将其进行下采样和分割分别得到下采样全视
野数字切片DWSI和肾小球感兴趣区域G ‑ROI, 构建数据集; 其中, 下采样全视野数字切片
DWSI为一个, 肾小球感兴趣区域G ‑ROI为1个或者多个;
S2、 对采样全视野数字切 片DWSI和肾小球感兴趣区域G ‑ROI进行质量等级标注, 获得专
家标签数据集;
S3、 将专家标签数据集中的下采样全视野数字切片DWSI输入融合卷积神经网络模型进
行训练, 得到DWSI分类模 型; 再将专家标签数据集中的肾小球感兴趣区域G ‑ROI输入融合卷
积神经网络模型进行训练, 得到G ‑ROI分类模型; 所述融合卷积神经网络模型为
EfficientNet和DenseNet卷积神经网络融合得到;
S4、 对待评估的全视野数字切片WSI进行下采样和分割, 得到下采样全视野数字切片
DWSI和肾小球感兴趣区域G ‑ROI, 将待评估的全视野 数字切片WSI中的下采样全视野 数字切
片DWSI输入训练完成的DWSI分类模 型, 得到下采样全视野 数字切片DWSI在各个质量类别下
的概率, 并计算其质量分数; 再将待评估的全视野数字切片WSI中的肾小球感兴趣区域G ‑
ROI输入G ‑ROI分类模 型, 得到肾小球感兴趣区域G ‑ROI在各个质量类别下的概率, 并计算其
质量分数; 最后将二者的质量分数进行加权平均得到待评估的全视野数字切片WSI的加权
质量分数SWSI;
S5、 根据S4中得到的加权质量分数确定待评估的全视野数字切片WSI的质量 等级。
2.根据权利要求1所述的一种基于 融合网络的医学图像质量评估方法, 其特征在于, 所
述步骤S1中, 采用openslide对全视野 数字切片WSI进行下采样得到下采样全视野 数字切片
DWSI, 下采样系数设置为16, 采用GLO ‑YOLO卷积神经网络对全视野数字切片WSI进行分割,
得到所有的肾小球感兴趣区域G ‑ROI。
3.根据权利要求1所述的一种基于 融合网络的医学图像质量评估方法, 其特征在于, 所
述步骤S1中, 数据集R的结构被设置为:
R={WSI1={DWSI1,G‑ROI11,G‑ROI12,…G‑ROI1i},
WSI2={DWSI2,G‑ROI21,G‑ROI22,…G‑ROI2i},
…,
WSIj={DWSIj,G‑ROIj1,G‑ROIj2,…G‑ROIji}, }, 1<i≤10;
WSIj表示第j个全视野数字切片WS I对应的数据, D WSIj表示第j个全视野数字切片WSI对
应的下采样全视野数字切片DWSI, G ‑ROIj1,G‑ROIj2,…G‑ROIji表示第j个全视野数字切片
WSI对应的第1, 2 ……i个肾小球感兴趣区域G ‑ROI。
4.根据权利要求1所述的一种基于融合网络的医学图像质量评估方法方法, 其特征在
于, 所述步骤S2中, 对每张图片进 行质量等级 标注时, 将图像定性地分为优秀、 良好、 一般和
差四个等级;
所述步骤S4中, 质量分数的计算方法为:
其中S表示类别数量, qj表示第j个类别对应的质量分数, pj表示第j个类别对应的概率,权 利 要 求 书 1/3 页
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2score表示质量分数;
所述步骤S4中, 加权质量分数ScoreWSI的计算公式为:
ScoreWSI=h×ScoreAG‑ROIs+(1‑h)ScoreDWSI;
其中, ScoreAG‑ROIs表示肾小球感兴趣区域GROI的质量分数, ScoreDWSI表示下采样全视野
数字切片 DWSI的质量分数; h表示权 重, h>0.5;
所述步骤S5中, 通过确定各个类别的隶属度函数, 遵循最大隶属度原则确定加权质量
分数对应的类别, 作为质量 等级。
5.根据权利要求4所述的一种基于 融合网络的医学图像质量评估方法, 其特征在于, 所
述步骤S4中, h=0.6 5。
6.根据权利要求1所述的一种基于融合网络的医学图像质量评估方法方法, 其特征在
于, 所述融合卷积神经网络模型包括:
EfficientNet网络主体: 用于对输入图片进行 特征提取;
第一全局平均池化层: 用于对EfficientNet网络主体提取的特征进行全局平均池化操
作;
Drop out层: 用于对第一全局平均池化层输出的数据进行丢弃法操作, 防止过拟合;
DenseNet网络主体: 用于对输入图片进行 特征提取;
第二全局平均池化层: 用于对DenseNet网络主体输出的数据进行全局平均池化操作;
Addition Layer层: 用于对Drop out层和第二全局平均池化层的输出进行拼接融合操
作;
全连接层: 用于将Ad dition Layer层输出的特 征映射到样本的标签空间;
softmax层: 用于对 全连接层输出的特 征向量进行归一 化操作。
7.根据权利要求1所述的一种基于融合网络的医学图像质量评估方法方法, 其特征在
于, 所述步骤S 3中, 训练 时采用ImageNet中的预训练参数来初始化模 型, 超参数的最大迭代
次数为50次, epoch大小被设定为16幅图像; 采用的Adam优化器的初始学习率设置为10‑3; 在
训练过程中, 采用动态学习率, 如果在训练过程中出现了损失平台, 将学习率降低到 当前的
1/10。
8.一种基于融合网络的医学图像质量评估系统, 其特 征在于, 包括:
图像处理模块: 用于对采集的肾组织的全视野数字切片WSI进行下采样和分割, 得到下
采样全视野数字切片 DWSI和肾小球感兴趣区域G ‑ROI;
DWSI分类模型: 用于对下采样全视野数字切片DWSI进行分类, 输出下采样全视野数字
切片DWSI的质量分数;
G‑ROI分类模型: 用于对各个肾小球感兴趣区域G ‑ROI进行分类, 输出各个肾小球感兴
趣区域G‑ROI的质量分数;
质量分数转换模块: 用于对下采样全视野数字切片DWSI的质量分数和各个肾小球感兴
趣区域G‑ROI的质量分数进行加权平均计算的得到全视野数字切片WSI的加权质量分数
SWSI;
综合质量预测模块: 用于根据全视野数字切片WSI的加权质量分数SWSI计算出其对每个
质量等级的隶属度, 并根据隶属度确定其质量 等级;
所述DWSI分类模型和G ‑ROI分类模型分别为下采样全视野数字切 片DWSI的标签数据和权 利 要 求 书 2/3 页
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专利 基于融合卷积神经网络的肾组织染色图像质量评估方法与系统
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